我们之前提到过，莫特鲁斯曾经在米撒通过奥科特兰山谷的时候，试图加入安奎利塔斯的军队，但被拒绝。由于势单力孤，他当时没有对萨赫利人发动进攻，而是在看到珀琉斯军队败走以后，回到了霍索恩。在前往霍索恩的路上，得知当时战况的安奎利塔斯的公民们对莫特鲁斯指指点点，充满不敬之意。不过，虽然安奎利塔斯的公民对莫特鲁斯心怀恶感，可莫特鲁斯本人一直都期待着一个契机，能让他为国效力，收复安奎利塔斯人失去的领土。后来，当米撒在加尔布雷斯被刺重伤，一个名叫波吕克斯的爱国者发动起一场声势十分浩大的军事起义。他和在其他各地的反抗者共同组成了一个名叫“反萨赫利同盟”的组织，一起协同对萨赫利人作战。也就是这个波吕克斯，他十分仰慕莫特鲁斯的功绩和人格，因此他邀请莫特鲁斯参加到自己的同盟之中。莫特鲁斯十分感激波吕克斯的建议，他立刻就带着自己的伙伴们前往波吕克斯麾下服役。在以后的战役里，由于莫特鲁斯和他的伙伴们每次作战都身先士卒，最为勇猛，因此在“反萨赫利同盟”这个组织里的人逐渐觉得自己国人曾经对莫特鲁斯的非议是错误的了。久而久之，当安奎利塔斯的各地公民们听说莫特鲁斯在为他们的自由奋力抗争，不惜牺牲以后，他们也转变了自己曾经的看法，认为莫特鲁斯过去的一切不利传闻，都是由于敌对党的迫害才出现的。当波吕克斯看到莫特鲁斯已经成功消弭了其余人对他的偏见后，波吕克斯就自愿让渡出指挥权，表示他和他的同伴们都期待接受莫特鲁斯的领导。

在法鲁格上任以后，已经是整个“反萨赫利同盟”中举足轻重一员的莫特鲁斯机敏地觉察到法鲁格一系列政策的不得人心，因此他到处拉拢尚处于独立状态下的安奎利塔斯地区共同反抗萨赫利人的进攻。安奎利塔斯地区内，一直以来处于萨赫利人威胁下的比雷埃夫城首先响应莫特鲁斯的号召，他们打开城门，把莫特鲁斯的军队接近城中。督察官们派出一支军队前去围剿，但被莫特鲁斯打败。于是紧接着更多的地区表示要加入到“反萨赫利人同盟”之中，包括许多当时还在萨赫利人治下的地区。莫特鲁斯认识到，一个松散的同盟组织不足以与萨赫利人对抗，因此他号召各个城市和地区派出自己的代表，在比雷埃夫城举行一次共同的会议，以商讨安奎利塔斯的未来。安奎利塔斯城内也有一些有权势或者有洞见的人也希望加入莫特鲁斯的会议中，因为他们担心如果现在不参加共同的会议，未来安奎利塔斯重建后，他们城市，连带着他们自己都不会享受到过去的待遇了。于是许多人聚集在安奎利塔斯城中密谋策划，并且推举出伊塔库亚作为他们的代表，前去参加在比雷埃夫举行的会议。

萨赫利人虽然没有完全限制特朗西特斯公民的自由行动，可他们在自己的统治边界各处都安置了哨站，并且禁止没有总督命令的人穿越。因此伊塔库亚把自己的女儿装进一个花轿，包裹的严严实实，他自己打扮成一个仆人，驾着马车穿越边境。在边境驻防的士兵们盘查伊塔库亚的时候，伊塔库亚就说，他是奉自己主人的命令给图尔基（督察官之一）送女人去的。由于当时类似的事情常有发生，士兵们也就轻易把伊塔库亚放了过去。赶到比雷埃夫的伊塔库亚马上换上高贵的行装，说他是以安奎利塔斯城代表的身份来参加莫特鲁斯主持的会议。

莫特鲁斯认识伊塔库亚，并且出于对他代表城市的尊重，把他安排在自己的右手边参加会议。在这次会议上，莫特鲁斯首先提出重建一个统一的政权，他说只有这样，安奎利塔斯人才能集合一切的力量对抗萨赫利人，并且重新在联军的共同议事会中取得讨论权——当时的共同议事会欺侮安奎利塔斯人没有统一与合法的政权，长久漠视安奎利塔斯代表的提议。他的这个提议得到了所有人的赞同，于是莫特鲁斯接着说，他们或许可以直接模仿过去安奎利塔斯人的政治结构组成新的政府，大多数的代表对此也同意了。但波吕克斯这时站起来说，以往安奎利塔斯人的政府只适合在和平或者情况并不紧急的情况下使用，而绝不适合一个正在为博取自由与强敌战争时的国家。他举了历史上许多故事，还有安奎利塔斯自己身上发生的故事为例，说明一个民主的政府在最理想的状态下，办事效率仍然低下，更何况人们为了自己的私利，经常还会出卖国家的利益。因此波吕克斯提议他们应该设置一个独裁官，就像巴西尔建立他们刚刚想要模仿的政府时拥有的官职，波吕克斯说，这绝不是一种对自由的剥夺或者说倒退，而是为了维护自由的权宜之计，在历史上有许多民主政权都是通过设立短暂的独裁官才渡过了亡国危机。波吕克斯的一番话让与会大多数人改变了看法，他们又开始支持在过去的政府基础上，暂时增设一个统领一切的独裁官。不过来自布鲁尔城的代表科塔强烈反对这个措施，他指着波吕克斯问莫特鲁斯，波吕克斯说的话是不是莫特鲁斯指示的。莫特鲁斯和波吕克斯都站起来否认，其中波吕克斯十分激动地说，科塔又要把私人的恩怨牵扯到公共利益上面了。最终没有人响应科塔的话，莫特鲁斯与波吕克斯的提议被通过。接着，伊塔库亚说既然大家同意独裁官的设立，那么在这次会议上就应该选出他们的独裁官，以免国家再度出于无人领导的状态。几乎所有人都提议莫特鲁斯担任这个职务，只有科塔提议他自己担任，于是莫特鲁斯以绝对多数当选为安奎利塔斯的独裁官，负责统领一切国家事务。

大部分记载都说，在这场会议之前，莫特鲁斯和波吕克斯达成过秘密的约定，不过就算这是真的，他们的所作所为也无可指摘，因为那个时代持有共同立场的人，总是习惯为避免失败而采取联合的行动。莫特鲁斯在上任后，首先派出以科塔等十人组成的使团前往帕蒂略斯，取代过去一些年一直在那里工作的安奎利塔斯代表们，以昭示安奎利塔斯已经重生。莫特鲁斯任命科塔担任这个职位，是因为他看中科塔雄辩的口才，还有那坚韧不屈的性格，当然，也有可能是像某些人记述的那样，他希望把科塔调到一个远离自己的地方任职。之后，莫特鲁斯开始改革军制，他认识到，安奎利塔斯时常作战失败，并不完全是由于安奎利塔斯人的性格软弱，而是士兵们在频繁的变动中，既不熟悉自己的军旗，又不熟悉自己的将官。当时安奎利塔斯的军制是佩洛·麦齐纳制定的，他看到在过去的年代里，团结在一个军团下，或者团结在一个将领下的士兵们是多么嚣张跋扈，因此他解散了军团的编制，每年变换安奎利塔斯的军旗和将官，还有士兵们的驻守位置，以期割散士兵们的联系，削弱士兵们的力量。佩洛的举措确实成功了，在那以后的两百年里，安奎利塔斯再也没有发生过不可遏制的士兵暴动，不过同时安奎利塔斯人的战斗力也被极大削弱。而莫特鲁斯在权衡当时的各方面利弊后，决定恢复军团建制。他规定每个军团最多六千名士兵（当然，随着实际情况的变化，士兵数量还有兵种搭配都会跟随改变），还允许每个军团保留一部分医生和建筑师等随军人员。他一共建立了四个军团，并亲自给每个军团赋以独特的名称与军旗，分别是尤瑞斯、希帕索斯、梅若普、崔俄帕斯——曾经以这四个名称命名的军团，都在安奎利塔斯的历史上立下过赫赫战功。不过莫特鲁斯改制时仍然有所保留，他不仅不允许任何一个军团指挥官在自己的军团上任期超过一年，而且不允许卸任的他们继续留在相同的军团内服役。